您的位置:首頁 > 技術(shù)文章 > 人肝內(nèi)膽管癌細胞STR鑒定標準操作流程與結(jié)果解讀指南
技術(shù)文章
一、標準操作流程
樣本準備:從人肝內(nèi)膽管癌細胞系中提取基因組DNA,確保樣本具有代表性且細胞數(shù)量充足。DNA提取可使用商用試劑盒或傳統(tǒng)有機溶劑法,提取后需檢測DNA濃度和純度,以滿足后續(xù)檢測要求。
STR位點擴增:選取人類基因組中高度多態(tài)性的13-24個STR位點,如TH01、TPOX、vWA等,使用特異性引物和PCR技術(shù)擴增這些位點。引物通常標記熒光,便于后續(xù)檢測。
電泳分離與檢測:將PCR擴增產(chǎn)物進行毛細管電泳分離,利用熒光檢測系統(tǒng)(如ABI3500遺傳分析儀)檢測電泳分離后的STR片段長度,生成電泳圖譜。
數(shù)據(jù)分析:根據(jù)電泳圖譜分析各STR位點的等位基因(片段長度),生成細胞系的STR基因型。將獲得的STR基因型與已知細胞系的STR數(shù)據(jù)庫(如ATCC、DSMZ等)進行比對,確認細胞系身份或檢測是否存在交叉污染。
二、結(jié)果解讀指南
匹配度判定:若受檢細胞STR位點的基因分型數(shù)據(jù)與其對應的標準細胞系匹配度≥80%,則判定為標準細胞系或其衍生細胞系;若匹配度在56%-80%之間,需結(jié)合細胞系形態(tài)、特異性標記物等輔助分析進行綜合判斷;若匹配度≤56%,則判定與其對應的標準細胞系不相關(guān)。
多等位基因分析:人源細胞STR圖譜上,一個基因位點通常只出現(xiàn)1個或2個峰(純合或雜合)。若出現(xiàn)3個及以上峰,可能提示存在同源物種交叉污染或三倍體等多倍體突變現(xiàn)象。
交叉污染檢測:通過比對多個細胞樣本的STR基因型,可檢測是否存在細胞系間的交叉污染。若檢測到混合樣本中的不同STR基因型,則確認存在多種細胞來源。